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[导读]北京2025年8月13日 /美通社/ -- 近日,北京积算科技有限公司(以下简称"积算科技")推出一站式AlphaFold3在线算力服务,现已开放免费使用。其内置优化后的AlphaFold3模型,支持图形化界面创建容器、低代码启动任务,通过在线服务让科研人员绕...

北京2025年8月13日 /美通社/ -- 近日,北京积算科技有限公司(以下简称"积算科技")推出一站式AlphaFold3在线算力服务,现已开放免费使用。其内置优化后的AlphaFold3模型,支持图形化界面创建容器、低代码启动任务,通过在线服务让科研人员绕开繁琐的部署、设置和调试,实现零门槛使用,以更简单、高效的方式完成蛋白质结构预测。

AlphaFold3一经发布就广受关注,它利用Transformer、扩散模型和进化信息多序列比对,不仅能高精度预测蛋白质结构,更能预测大部分生物分子的结构及其相互作用。与传统方法相比,在预测蛋白质与一些分子的"对接"方面精度提升高达50%,在药物研发、疾病机理研究、精准医学等领域应用广泛。

AlphaFold3计算过程高度复杂,涉及大规模MSA、深度特征提取、迭代结构预测及优化,对算力平台硬件配置要求高:GPU计算卡需要大容量显存和高带宽、计算节点大容量内存、数据存储容量超700G等。同时使用门槛高,在部署和使用过程中,往往需要通过命令行直接在操作系统界面进行操作,涉及数十句代码命令,需要操作人员具备一定的计算机编程基础。如果通过官方网站使用AlphaFold3,则存在每个账户每天限额20个任务、仅够试错2-3个靶点、输入长度限制等问题。

针对以上问题,积算科技在其算力服务平台正式上线AlphaFold3应用,为用户提供高效、易用的在线算力服务。用户开通服务后,无需部署即可在线使用AlphaFold3的全部功能,无需排队等待,支持最大5120AA(氨基酸,amino acid)的输入,并具有低代码操作、图形化容器搭建等特点,可大幅提升用户的使用体验。

积算科技算力服务平台支持图形化界面、低代码开发,极大地降低了使用门槛。用户远程登录平台后,通过图形化界面快速创建容器环境,只需要通过鼠标点击选择预置好的镜像、数据集及用户自行上传的输入序列,30秒内便可完成预测前的所有准备。之后,用户只需要进入容器,通过集成好的在线shell界面输入简单的两句代码,为AlphaFold3程序指定文件位置,回车运行即可体验强大算力带来的高水平运算速度。

支撑该算力服务平台的算力系统以高速InfiniBand计算网络为核心构建,配置全闪NVMe SSD共享存储,计算节点采用64核处理器核心、1TB大容量内存、8张GPU计算卡,显存容量超640G,为用户带来极高的性能体验,加速结果生成。此外,平台基于容器进行算力调度和资源管理,具备强大的平台管理、用户管理、资源管理等功能,帮助用户快速完成蛋白质结构预测。

积算科技秉承以客户为中心的服务理念,来自生物、医学、材料学、计算机等不同专业领域的团队成员紧密合作,从初期调研,到软件安装,再到作业测试,全程提供专业、可靠的技术解决方案。此外,积算科技撰写了AlphaFold3使用教程,帮助用户快速上手。

以740aa_4a5s.json为例,输出的结果存放在用户指定的文件夹。由于AlphaFold3并未集成结果可视化模块,待任务完成后,客户可将结果文件夹中的cif及json文件下载,使用pymol或paeViewer等工具进行可视化分析。

实测结果图如下(740aa_4a5s.json):

结构配色方案:按子单位(左图);结构配色方案:模型置信度(右图)


结构配色方案:按子单位(左图);结构配色方案:模型置信度(右图)

积算科技诞生于全球生成式AI浪潮,专注于智能算力服务市场,致力于成为中国最具价值的智能算力服务商,聚焦互联网、运营商、高校、新能源汽车等领域的多家头部客户提供算力服务。公司拥有万卡级先进智能算力资源池,提供裸金属、智能算力系统、专属智能算力系统等算力服务产品,适用于大模型训练与推理、算法研究、大数据分析、自动驾驶、智能科学计算等多元场景。其运维和服务团队具备大规模智能算力系统设计建设、大模型开发应用及性能优化能力,可提供全栈大模型应用开发服务支持,并根据客户需求提供灵活服务模式。

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