NVIDIA 发布 BioNeMo Agent Toolkit——加速科学发现的智能体工具

新闻摘要：

• 包括达索系统、Databricks、礼来、Schrödinger、Snowflake、华盛顿大学医学院蛋白质设计研究所在内的行业和研究机构领导者正在采用 NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit;Anthropic 和 OpenAI 也在集成该工具包，旨在为研究人员和科学家提供智能体驱动的生命科学工作流。

• NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 涵盖了 NVIDIA Nemotron、NemoClaw、OpenShell 和 BioNeMo 等组件，为 AI 智能体提供了加速生命科学研究的工具，全面覆盖生物学、化学、基因组学及药物研发等领域。

• 全新的 NVIDIA BioNeMo 工具赋予了智能体执行科学计算所需的上下文与专业知识，从而提升了计算的准确性、任务完成率以及 Token 使用效率。

NVIDIA 今日宣布推出 NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit，为智能体生命科学时代提供专业领域的工具与技能。

该工具包汇集了 NVIDIA 十多年来积累的生命科学库、工具和开放模型，使 AI 智能体、科研人员和实验室能够协同工作：通过收集证据、跨研究结果进行推理、执行计算实验以及推荐最佳后续步骤，加速科学发现。

它为各类智能体和 AI 平台——从通用助手到专业科学智能体、软件平台及企业内部的生物制药系统提供所需工具，使其能够综合与总结科学知识、调用模型、评估结果、进行推理并执行后续行动。

该工具包包含 NVIDIA BioNeMo™，并由 NVIDIA NIM™ 微服务、NVIDIA Parabricks®、NVIDIA NeMo™ 和 NVIDIA Nemotron™ 技术以及加速计算能力与技能提供支持，为生命科学领域的智能体构建了一个开放且可信的基础。

目前已有超过 50 家头部企业在使用该工具包推进科学发现，利用其可供智能体调用的技能来完成各类任务，包括蛋白质结构预测、分子对接、生成式化学、基因组分析、蛋白质设计和生物标志物发现等。

NVIDIA 创始人兼首席执行官黄仁勋表示：“前沿模型是大脑， BioNeMo 是科学工具箱。两者结合，赋予了 AI 智能体博士级研究助理的专业技能和超级计算机的运行速度。这是研究人员首次能够构建出能够理解科学知识、使用科学工具并执行科学工作流的 AI 智能体。这是一种全新的科学研究方式，能够大幅加速生物学、化学、基因组学和医学领域的发现进程。”

包括 Arc Institute、开放分子软件基金会(OMSF)以及华盛顿大学蛋白质设计研究所(IPD)在内的开放模型和研究组织，正与 NVIDIA 合作，利用 BioNeMo 推进前沿模型的发展，并通过支持智能体就绪的工作流，使前沿模型更易于被广泛使用。IPD 的合作大幅缩短了 RosettaFold3 等顶尖生物设计模型的运行时间，使其性能比上一代模型提升了 2 倍。此外，还有更多旨在加速蛋白质设计的应用正在推进中，为研究人员提供了具有前所未有的规模和成本优势的科研工具。

华盛顿大学医学院生物化学教授兼蛋白质设计研究所所长 David Baker 表示：“我们为蛋白质设计打造的每一款工具，只有在科研人员能够高效访问时才能发挥其强大威力。科学的下一次飞跃不会来自单一发现，而是得益于迭代设计的速度，以及智能体能够以人类无法企及的速度，不断对复杂生物学问题进行推理的能力。”

面向生命科学的智能体就绪工具与技能

生命科学是全球最重要的科学前沿之一，全球科学研发支出已达 3.8 万亿美元，年度制药预算接近 3000 亿美元。

智能体工作流可帮助生命科学行业加快迭代速度，同时降低成本并提升研发成功概率。借助该工具包，开发者只需几分钟即可将通用智能体转化为生命科学专用智能体。研究人员可以更快地开展实验，持续从结果中学习，并打通假设到发现的闭环。部分企业已将这一迭代延过程伸至实体实验室中。

通用智能体在高效处理科学工作流时往往会遇到瓶颈，需要在过程中不断推断正确的工具、输入输出以及生物学意义。有了 BioNeMo Agent Toolkit，智能体能够精准调用合适的工具，更准确地解读结果，从而更快、更可靠地获取科学洞察。

NVIDIA 正在通过将各类库、模型和框架转化为可供智能体调用的工具，来优化整个 BioNeMo 平台。

这包括利用 NVIDIA Agent Toolkit 的多项技术，例如作为推理基础的 NVIDIA Nemotron 开放模型、用于强化学习的 NVIDIA NeMo RL 库，以及用于构建安全、私密智能体的 NVIDIA NemoClaw™ 蓝图，这类智能体能够跨任务推理、调用工具并持续与数据交互。

NVIDIA NIM 微服务帮助智能体调用模型并执行任务，NVIDIA OpenShell™ 运行时则提供受控的可执行环境。

借助该工具包组件，智能体能够完成以下工作流：

• 虚拟筛选：智能体能够通过生成和筛选化合物、将其与靶点对接、预测结合强度以及筛选具备成药性的候选分子，帮助研究人员发现小分子药物候选物。随后，智能体可输出应优先选择的候选药物，将筛选周期从数天缩短至几分钟。

• 基因组分析与靶点发现：智能体能够帮助研究人员将原始测序数据转化为高优先级的基因洞察和生物学靶点。NVIDIA Parabricks 加速了序列比对和变异检测，基因组基础模型用于评估变异效应，智能体则对与疾病最相关的候选靶点进行排序，以供进一步研究。

• 蛋白质结合物设计：智能体可在实际工作开始前，通过计算方式设计和验证候选物，从而压缩传统上耗时费力的设计工作。

• 深度生物医学研究：智能体能够借助 NVIDIA Biomedical AI-Q Research Agent，将真实世界数据与推理模型相连接，以提高各类科学和临床开发流程的效率与准确性，涵盖文献回顾、方案生成、临床试验筛选和药物警戒等工作。

• 医学影像分析：智能体能够帮助研究人员处理、分割、生成并分析医学影像数据，以支持生物标志物的发现，加速整个研究工作流中的证据生成。

基于 NVIDIA BioNeMo 构建的生命科学生态系统

技术和生命科学生态系统中的众多企业正在使用该工具包推进智能体工作流。

包括 Anthropic、Edison Scientific、Lila Sciences、OpenAI 和 Owkin 在内的前沿实验室和科学智能体构建者，正将 BioNeMo 集成至其平台，推动智能体从“回答问题”迈向“完成科学工作”。NVIDIA 加速模型和分析库有助于缩短从假设到洞察的周期。

来自 Benchling、Certara、Databricks、Snowflake 和 Seqera 的科学数据和工作流平台正在使用 BioNeMo Agent Toolkit，将数据系统与 AI 驱动的科学相连接。BioNeMo 的各项技能可帮助智能体查询生物和化学数据集、准备适用于模型就绪的输入、启动可复现的工作流、分析输出，并直接在科学家和数据团队日常使用的平台中返回洞察。

包括礼来和 Natera 在内的诊断和制药公司，正在使用 BioNeMo Agent Toolkit，将可复用的智能体工作流规模化应用于药物研发、转化研究及临床洞察等各个环节。

包括 Boltz、Basecamp Research、Chai Discovery、Dyno、PerturbAI 和 Proxima 在内的 AI 原生生物科技企业已与 NVIDIA 合作，开发旨在加速模型驱动的治疗设计工作流的工具。

达索系统、Cadence(OpenEye)和 Schrödinger 等计算机辅助药物研发软件提供商，正将该工具包的能力集成到研发团队广泛使用的科学应用中。借助智能体协调分子生成、对接和预测，这些计算机辅助设计平台正转变为研究人员可以提问、启动分析并更快识别最佳后续步骤的系统。

Automata、HighRes、帝肯、赛默飞世尔科技等实验室仪器与自动化企业，以及自主数据生成平台 Medra，正利用 BioNeMo 技能将系统与计算发现相连接。

Baseten、Modal 和 Nebius 等 AI 云和 AI 基础设施企业，正在使用该工具包帮助开发者将生命科学工作流构建为可靠的托管服务。通过支持可扩展的 API、托管计算和生产级推理环境，这些公司正帮助将智能体生物学工作流从原型转化为研究人员和企业可便捷获取的服务。